Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIN3AQ96ST3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SIN3AQ96ST3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms