Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SUSD3Q96L08 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms