Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC135012.1-201ENST00000563931 7430 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 RNF150-206ENST00000515673 9805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 COBLL1-202ENST00000375458 9367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AK4-201ENST00000327299 6836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 NCAM1-225ENST00000618266 5937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 NUDCD3-202ENST00000355451 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms