Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms