Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ULK4Q96C45 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ULK4Q96C45 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms