Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms