Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTTNBP2Q8WZ74 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms