Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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ZNF248Q8NDW4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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ZNF248Q8NDW4 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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ZNF248Q8NDW4 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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ZNF248Q8NDW4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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ZNF248Q8NDW4 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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ZNF248Q8NDW4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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ZNF248Q8NDW4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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