Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF148Q8N7C7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms