Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms