Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms