Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms