Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms