Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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C9orf135Q5VTT2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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C9orf135Q5VTT2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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C9orf135Q5VTT2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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C9orf135Q5VTT2 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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