Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PERM1Q5SV97 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms