Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms