Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms