Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms