Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms