Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARHGAP29Q52LW3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms