Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC153Q494R4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms