Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KNOP1Q1ED39 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms