Protein–RNA interactions for Protein: Q1A5X7

WHAMMP3, Putative WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMP3Q1A5X7 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms