Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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CDKN3Q16667 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN3Q16667 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN3Q16667 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN3Q16667 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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CDKN3Q16667 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN3Q16667 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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CDKN3Q16667 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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CDKN3Q16667 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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CDKN3Q16667 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN3Q16667 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN3Q16667 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN3Q16667 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN3Q16667 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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CDKN3Q16667 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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CDKN3Q16667 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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CDKN3Q16667 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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CDKN3Q16667 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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