Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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CDSNQ15517 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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CDSNQ15517 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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CDSNQ15517 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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CDSNQ15517 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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CDSNQ15517 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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