Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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