Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms