Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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SSPNQ14714 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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SSPNQ14714 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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SSPNQ14714 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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SSPNQ14714 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SSPNQ14714 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SSPNQ14714 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SSPNQ14714 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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