Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTTNQ14247 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms