Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139 ms