Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNC3Q14003 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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KCNC3Q14003 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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KCNC3Q14003 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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KCNC3Q14003 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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KCNC3Q14003 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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KCNC3Q14003 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNC3Q14003 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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