Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LAMB3Q13751 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms