Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PEX6Q13608 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PEX6Q13608 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PEX6Q13608 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PEX6Q13608 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PEX6Q13608 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PEX6Q13608 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PEX6Q13608 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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