Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA5AQ13591 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms