Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF5Q13568 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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IRF5Q13568 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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