Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms