Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C1orf61Q13536 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms