Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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ITGB3BPQ13352 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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ITGB3BPQ13352 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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ITGB3BPQ13352 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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ITGB3BPQ13352 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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ITGB3BPQ13352 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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ITGB3BPQ13352 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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