Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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CLN3Q13286 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
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CLN3Q13286 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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CLN3Q13286 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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CLN3Q13286 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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CLN3Q13286 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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CLN3Q13286 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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CLN3Q13286 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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CLN3Q13286 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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CLN3Q13286 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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