Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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