Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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