Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFX1Q12986 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms