Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXC1Q12948 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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FOXC1Q12948 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FOXC1Q12948 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FOXC1Q12948 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FOXC1Q12948 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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