Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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