Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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CNTN1Q12860 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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CNTN1Q12860 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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CNTN1Q12860 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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CNTN1Q12860 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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CNTN1Q12860 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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CNTN1Q12860 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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CNTN1Q12860 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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CNTN1Q12860 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN1Q12860 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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