Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXO1Q12778 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms