Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD300CQ08708 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms