Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms