Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2BQ00403 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms