Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms